More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0465 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0465  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 164 aa  330  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  72.39 
 
 		 161 aa  243  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.21 
 
 		 163 aa  196  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.41 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.56 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.88 
 
 		 162 aa  186  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.1 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.42 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  53.05 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.17 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.61 
 
 		 162 aa  177  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.8 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.73 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1374  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.22 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000213066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.8 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1382  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.53 
 
 		 170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.17 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1229  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.56 
 
 		 165 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1813  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 161 aa  166  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1292  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.56 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0683145  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0585  regulator of ribonuclease activity A  51.9 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.444909  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.83 
 
 		 159 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  58.65 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  50 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1354  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.15 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2492  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.17 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000420166  hitchhiker  0.0053907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.04 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1124  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.03 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.22942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2372  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.91 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.31 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5682  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.47 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5435  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.05 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.89586  normal  0.892268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1645  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.85 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002756  normal  0.0229312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  48.77 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.38 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.2 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5056  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.05 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5144  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.05 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  46.34 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.2 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.02 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  52.83 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3615  regulator of ribonuclease activity A  51.3 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13889  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.61 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4363  regulator of ribonuclease activity A  48.77 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1638  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.85 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000156979  normal  0.0371486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.02 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  46.91 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004459  ribonuclease E inhibitor RraA  43.83 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0150677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.34 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1955  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.12 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2009  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.79 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00664884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00936  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.83 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.12 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.12 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.12 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0136  regulator of ribonuclease activity A  45.34 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.657064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  42.07 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2410  regulator of ribonuclease activity A  44.72 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.3 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1485  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.05 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.108799  normal  0.282904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1665  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0163  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.29 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.29 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4795  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000170987 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.04 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.14 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2025  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.38 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0114  regulator of ribonuclease activity A  46.98 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.344528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.07 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.72 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0177  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.46 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0220  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.85 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000505209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03814  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4089  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5386  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4464  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03763  hypothetical protein  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4411  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.081305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4070  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.07 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4161  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>