More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1638 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  100 
 
 		 159 aa  316  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  89.31 
 
 		 159 aa  289  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  75 
 
 		 163 aa  226  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  70.44 
 
 		 159 aa  220  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4363  regulator of ribonuclease activity A  66.88 
 
 		 162 aa  208  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2492  regulator of ribonuclease activity A  66.89 
 
 		 170 aa  200  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5435  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.67 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.89586  normal  0.892268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5056  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.67 
 
 		 159 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5144  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.67 
 
 		 159 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5682  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.9 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1124  ribonuclease activity regulator protein RraA  65.1 
 
 		 160 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.22942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0271  regulator of ribonuclease activity A  61.59 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  62.91 
 
 		 155 aa  190  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13889  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.07 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0114  regulator of ribonuclease activity A  61.04 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.344528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  58.67 
 
 		 161 aa  186  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.2 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3997  ribonuclease activity regulator protein RraA  60.53 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3776  ribonuclease activity regulator protein RraA  66.44 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.63 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.9 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.09 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0136  regulator of ribonuclease activity A  50.99 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.657064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  48.1 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1984  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.63 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0137329  normal  0.331323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.15 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2373  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.97 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00367036  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.84 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.13 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2165  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.66 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0632667  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2242  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.66 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132469  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2007  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.32 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2332  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.32 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00982975  hitchhiker  0.00847233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.32 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.816132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2615  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.78337  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0538  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.37 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2055  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.32 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215493  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.36 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.77 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.77 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.03 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0420602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.77 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2567  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.71 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.69 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.85 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2117  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.2 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.86066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.5 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.41 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.84 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004459  ribonuclease E inhibitor RraA  41.14 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0150677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.2 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1382  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.79 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2410  regulator of ribonuclease activity A  46.05 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.72 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.2 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3549  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00109264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0407  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000143495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3723  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00679648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0463  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3327  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.87 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 175 aa  146  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1638  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.91 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000156979  normal  0.0371486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.32 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.14 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0585  regulator of ribonuclease activity A  48.39 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.444909  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3047  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.87 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00936  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.77 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1665  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.31 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4094  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3012  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000537886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  44.94 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0530  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.3 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3321  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.35 
 
 		 167 aa  143  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  49.26 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2210  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.11 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.68 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2025  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.39 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3122  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3109  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.59 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3615  regulator of ribonuclease activity A  49.67 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3368  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.23 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.69 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3790  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.67 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.68 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>