271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0114 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0114  regulator of ribonuclease activity A  100 
 
 		 163 aa  323  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.344528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0136  regulator of ribonuclease activity A  69.14 
 
 		 166 aa  227  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.657064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13889  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.55 
 
 		 157 aa  223  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5435  ribonuclease activity regulator protein RraA  73.38 
 
 		 159 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.89586  normal  0.892268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5056  ribonuclease activity regulator protein RraA  72.73 
 
 		 159 aa  219  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5144  ribonuclease activity regulator protein RraA  72.73 
 
 		 159 aa  219  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1124  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.03 
 
 		 160 aa  214  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.22942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5682  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.68 
 
 		 160 aa  214  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0271  regulator of ribonuclease activity A  64.94 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2492  regulator of ribonuclease activity A  61.69 
 
 		 170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  61.04 
 
 		 159 aa  187  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  59.74 
 
 		 155 aa  183  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4363  regulator of ribonuclease activity A  57.59 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  56.49 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.14 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  54.09 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.87 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.61 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3997  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.55 
 
 		 176 aa  156  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.7 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.7 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.7 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3776  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.19 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.75 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.05 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.4 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.67 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.4 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  43.51 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.51 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2165  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.33 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0632667  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2242  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.33 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132469  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2373  ribonuclease activity regulator protein RraA  48 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00367036  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.39 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.05 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  49.26 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.14 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.14 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.14 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004459  ribonuclease E inhibitor RraA  44.16 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0150677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.21 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.87 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.88 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.1 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.1 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.1 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2567  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.42 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2025  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.39 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2615  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.11 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.78337  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2007  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.33 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.33 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.816132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.94 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1984  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.45 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0137329  normal  0.331323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2117  ribonuclease activity regulator protein RraA  44 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.86066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0163  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.81 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.65 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.29 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2055  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.33 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215493  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0177  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.81 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2332  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.33 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00982975  hitchhiker  0.00847233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4795  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000170987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3549  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00109264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0407  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000143495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3723  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00679648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.21 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2210  ribonuclease activity regulator protein RraA  44 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00936  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.52 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0538  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.33 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  40.91 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03814  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4464  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03763  hypothetical protein  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5386  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.79 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0420602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4161  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.65 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4089  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0111  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.45 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.530064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4411  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.16 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.081305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4421  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.51 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4305  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.51 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4419  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.51 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4335  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.51 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0948467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.26 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4489  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.51 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0465  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.97 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4044  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.21 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.61 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0220  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.13 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000505209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>