More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1645 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1645  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002756  normal  0.0229312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2492  ribonuclease activity regulator protein RraA  92.07 
 
 		 164 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000420166  hitchhiker  0.0053907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1374  ribonuclease activity regulator protein RraA  76.69 
 
 		 164 aa  251  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000213066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1229  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.2 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1292  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.2 
 
 		 165 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0683145  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.19 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1382  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.19 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.42 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.58 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1354  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.8 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.17 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.92 
 
 		 163 aa  174  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.56 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2372  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.47 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.43 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.31 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1955  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.18 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2009  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.09 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00664884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.47 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3615  regulator of ribonuclease activity A  53.75 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.15 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.34 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  45.4 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.15 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.45 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.12 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0585  regulator of ribonuclease activity A  49.06 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.444909  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1813  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.12 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.96 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.32 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.17 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  43.9 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.91 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.96 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.51 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3327  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.1 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3047  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.48 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  51.18 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.77 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3012  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.24 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000537886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3122  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.24 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3368  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  46.01 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3321  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.1 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0220  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.85 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000505209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3109  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.86 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  45.4 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0465  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.85 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00936  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.49 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2410  regulator of ribonuclease activity A  43.31 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2007  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.5 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.816132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2210  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.59 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2117  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.17 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.86066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2055  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215493  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004459  ribonuclease E inhibitor RraA  39.26 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0150677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.88 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.46 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  39.26 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.63 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0463  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.46 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  43.98 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0867  regulator of ribonuclease activity A  40.49 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.822273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.24 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0271  regulator of ribonuclease activity A  43.12 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.24 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.24 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3549  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.63 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00109264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0407  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.63 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000143495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3723  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.63 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00679648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3296  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.24 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.63 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.24 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.85 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  47.17 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.85 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.85 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.46 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  39.63 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.85 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  40.85 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>