More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1354 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1354  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 168 aa  343  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1292  ribonuclease activity regulator protein RraA  80.37 
 
 		 165 aa  279  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0683145  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1229  ribonuclease activity regulator protein RraA  79.75 
 
 		 165 aa  278  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  71.07 
 
 		 165 aa  237  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1382  ribonuclease activity regulator protein RraA  65.87 
 
 		 170 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.94 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.18 
 
 		 165 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.1 
 
 		 164 aa  221  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1374  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.78 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000213066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2492  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.2 
 
 		 164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000420166  hitchhiker  0.0053907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1645  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.8 
 
 		 164 aa  210  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002756  normal  0.0229312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.06 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.44 
 
 		 159 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  59.74 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0585  regulator of ribonuclease activity A  56.89 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.444909  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.88 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2372  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.5 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.92 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.88 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.5 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1955  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.42 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2009  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.61 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00664884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.38 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3615  regulator of ribonuclease activity A  54.6 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.04 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.39 
 
 		 163 aa  157  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.37 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  48.47 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1813  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0220  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.56 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000505209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0465  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.15 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  47.85 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  47.77 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  52.21 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  49.69 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.84 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.2 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.77 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  46.5 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3327  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.5 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.12 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4363  regulator of ribonuclease activity A  47.56 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.4 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.12 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3047  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.4 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3122  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3109  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3368  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3012  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.79 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000537886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3321  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.4 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.22 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.17 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2007  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.51 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2165  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.06 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0632667  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2242  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.06 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132469  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2055  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.9 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215493  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2373  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.45 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00367036  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2117  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.5 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.86066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2567  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.68 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.86 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2410  regulator of ribonuclease activity A  42.94 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300312  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.79 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2210  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.56 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.94 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13889  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.33 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.94 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.94 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.29 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.816132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4795  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.1 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000170987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2332  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.29 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00982975  hitchhiker  0.00847233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.33 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5435  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.56 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.89586  normal  0.892268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5056  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.33 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5144  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.33 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1124  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.23 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.22942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4070  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.59 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  40.88 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03814  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4411  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.081305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.04 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.64 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0420602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03763  hypothetical protein  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4161  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4464  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5682  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.99 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>