99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1778 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  359  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  359  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  40.11 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  35.91 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  40.88 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  40.88 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  34.64 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  34.64 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  30.63 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  29.67 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  29.12 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  31.68 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.85 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  31.68 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  35.58 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  28.65 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  34.76 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  28.49 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  30.49 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  33.76 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.81 
 
 
344 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  33.76 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  31.84 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  35.43 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  36.43 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  36.43 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  36.43 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  37.74 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  24.71 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  28.57 
 
 
333 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  26.25 
 
 
169 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  33.94 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  36.61 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  31.17 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  27.71 
 
 
177 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  31.03 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  35.85 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  33.33 
 
 
323 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  34.88 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  28.66 
 
 
336 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  28.66 
 
 
336 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  30.52 
 
 
315 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  28.66 
 
 
336 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  28.66 
 
 
329 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  28.66 
 
 
336 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  28.66 
 
 
345 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  28.66 
 
 
336 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  30.52 
 
 
315 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  29.65 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  26.59 
 
 
372 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  25 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  27.38 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  29.01 
 
 
323 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  27.38 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  27.38 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  29.22 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  25 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  27.54 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  27.38 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  27.38 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  33.86 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  25 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  26.79 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  33.02 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  30.84 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30.46 
 
 
339 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  31.11 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  39.06 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  30.47 
 
 
323 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  39.06 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  31.47 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  29.85 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  33.03 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  23.81 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  26.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  32.74 
 
 
321 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  28.14 
 
 
205 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  26.79 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  31.25 
 
 
318 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  23.81 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  33.12 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  32.48 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  29.93 
 
 
323 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  32.48 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  33.76 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  28.79 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  27.69 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.59 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  34.74 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  28.57 
 
 
178 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  27.34 
 
 
323 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  23.64 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  27.22 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  23.64 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  23.64 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  23.64 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>