55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0677 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  337  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  99.4 
 
 
234 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  333  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  333  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  333  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  99.4 
 
 
181 aa  332  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  98.8 
 
 
181 aa  331  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  90.42 
 
 
167 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  38.6 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  37.95 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  38.12 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  38.12 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  38.12 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  38.12 
 
 
186 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  38.12 
 
 
186 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  38.12 
 
 
186 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  36.14 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  36.14 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  35.15 
 
 
178 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  33.73 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  30.67 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  34.39 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  34.34 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  36.31 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  32.69 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  35.71 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  32.69 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  36.31 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  33.76 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  30.57 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  32.48 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  32.09 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  32.09 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  32.09 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  32.09 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  32.09 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  32.09 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  30.6 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  29.22 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  29.65 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  26.25 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  24.68 
 
 
148 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.07 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  26.83 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  27.67 
 
 
182 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  28.07 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  23.21 
 
 
181 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  26.71 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  27.65 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  27.93 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  28.74 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  27.49 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>