87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3671 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  100 
 
 		 166 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  58.55 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  57.89 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  57.89 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  55.26 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  46.34 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  38.51 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  42.94 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  42.94 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  42.94 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  42.35 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  42.35 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  42.35 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  42.35 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  31.93 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  32.6 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  28 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  29.88 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  29.89 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  35.8 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  35.19 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  32.99 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  33.53 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  32.88 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  35.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  35.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  35.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  35.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  35.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  35.1 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  33.86 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  31.88 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  33.33 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  31.88 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  32.19 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  32.72 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  34.81 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  25.33 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  24.67 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  28.77 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 372 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  30.16 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  32.26 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  29.03 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  26.62 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  32 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  29.22 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  29.22 
 
 		 234 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  29.22 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.73 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  29.22 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  29.22 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  29.22 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  29.22 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  28.67 
 
 		 333 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  32.09 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  26.59 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  30.56 
 
 		 318 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  28 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  29.05 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  25.6 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  28.95 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  29.09 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  29.49 
 
 		 323 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  27.59 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  27.59 
 
 		 331 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  28.86 
 
 		 339 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  32.08 
 
 		 324 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  27.27 
 
 		 344 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  23.84 
 
 		 163 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  30.28 
 
 		 320 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>