111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1267 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  100 
 
 
318 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  59.38 
 
 
320 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  57.63 
 
 
333 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  59.67 
 
 
331 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  65.44 
 
 
336 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  65.44 
 
 
345 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  59.34 
 
 
331 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  65.44 
 
 
336 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  65.1 
 
 
336 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  65.1 
 
 
336 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  65.1 
 
 
336 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  65.1 
 
 
329 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  63.76 
 
 
372 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  42.63 
 
 
325 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  30.14 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  43.07 
 
 
172 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  42.96 
 
 
173 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  43.07 
 
 
172 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  43.07 
 
 
185 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  43.07 
 
 
164 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  43.07 
 
 
164 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  43.07 
 
 
164 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  42.34 
 
 
165 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  46.15 
 
 
174 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  32.16 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  43.17 
 
 
165 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  41.61 
 
 
172 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  40.29 
 
 
178 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  41.73 
 
 
178 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  41.73 
 
 
178 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  42.54 
 
 
153 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  41.84 
 
 
167 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  34.29 
 
 
175 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  43.57 
 
 
154 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  43.57 
 
 
154 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  33.23 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  42.86 
 
 
160 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  46.09 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  42.74 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  42.62 
 
 
160 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  40.2 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  41.8 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  40.2 
 
 
163 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  40.2 
 
 
163 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  44 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  44 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  37.58 
 
 
156 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  31.62 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  40.6 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  41.73 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  40.6 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  38.17 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  39.29 
 
 
165 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  40.95 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  35.77 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  35.77 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  39.81 
 
 
170 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  41.96 
 
 
122 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.86 
 
 
167 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  31.36 
 
 
167 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  34.44 
 
 
185 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.25 
 
 
167 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  31.37 
 
 
182 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  38.71 
 
 
156 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  31.25 
 
 
184 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  31.25 
 
 
184 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  32.14 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  33.81 
 
 
175 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  28.47 
 
 
167 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  27.07 
 
 
321 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  30.56 
 
 
166 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  25.17 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  26.32 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  26.32 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  26.32 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  26.32 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  26.32 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  26.32 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  25.38 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  26.71 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  28.85 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  26.55 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  32.16 
 
 
168 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  32 
 
 
228 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  31.62 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  28.06 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  27.1 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  38.04 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  27.1 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  31.62 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  28.65 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  28.15 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  34.53 
 
 
173 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  30.88 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  29.21 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  30.1 
 
 
174 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>