65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1633 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  100 
 
 
186 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  99.46 
 
 
186 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  94.62 
 
 
186 aa  350  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  49.69 
 
 
205 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  39.76 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  38.12 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  38.12 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  38.12 
 
 
167 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  39.76 
 
 
234 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  38.12 
 
 
167 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  38.12 
 
 
167 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  36.25 
 
 
167 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  34.57 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  32.92 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  45.11 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  45.11 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  45.11 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  45.11 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  45.11 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  45.11 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  32.92 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  42.11 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  32.3 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  32.3 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  43.03 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  29.47 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  42.42 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  41.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  36.81 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  36.07 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  32.94 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  34.73 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  36.59 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  31.71 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  34.13 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  38.22 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  34.44 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  34.44 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  32.93 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  32.93 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  32.62 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  33.13 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  30.3 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  35.1 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  28.04 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  28.66 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.48 
 
 
148 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  28.92 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  28.49 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  29.27 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  34.72 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  34.72 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  34.72 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  26.63 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  26.63 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  30.56 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  25.79 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  25.79 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.2 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  32.2 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.73 
 
 
167 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>