80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001216 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001216  CsuB  100 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  38.51 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  34 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  34 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  34 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  32.24 
 
 		 182 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  31.33 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  28.67 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  28.67 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  30.2 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  31.45 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  31.45 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  31.45 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  32.45 
 
 		 190 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  30.2 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  30.65 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  29.33 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  32.48 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  28.67 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  28.86 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  27.27 
 
 		 182 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.72 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.72 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  27.81 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  27.33 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.26 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  29.75 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  28.8 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  28.89 
 
 		 344 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  24.83 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  29.6 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  27.78 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  26.75 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  26.75 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  28.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  28.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  29.03 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  24.68 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  24.68 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  24.68 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  24.68 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  24.68 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  24.68 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  24.68 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  29.03 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  26.62 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  29 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  29 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  29 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  29 
 
 		 345 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  29 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  29 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  29 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  30.67 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  20.92 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  28.39 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  23.75 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  24.16 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  22.82 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  25.81 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  25.56 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  23.81 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  24.84 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  30.3 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  26.79 
 
 		 331 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  32.26 
 
 		 331 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  28.35 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  27.63 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  30 
 
 		 372 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>