57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001215 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001215  CsuA  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  36.46 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  37.58 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  36.57 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  36.94 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  37.11 
 
 		 178 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  29.47 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  29.47 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  29.47 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  29.47 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  29.47 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  29.47 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  28.04 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  31.28 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  28.89 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  29.28 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  32.48 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  29.35 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  31.87 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  31.55 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  32.06 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  32.06 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  32.06 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  29.89 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  25.14 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  31.43 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  28.29 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  30.53 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  27.72 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  26.67 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  28.85 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  27.63 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  28.65 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  28.85 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  27.72 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  28.4 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  21.58 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  26.54 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  29.09 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  24.55 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  25.9 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  23.21 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  23.21 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  23.21 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  23.03 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  23.03 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  23.03 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  26.58 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  29.65 
 
 		 176 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  25.32 
 
 		 184 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  29.65 
 
 		 163 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  29.65 
 
 		 163 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  25.32 
 
 		 184 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>