78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2815 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  100 
 
 
182 aa  358  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  76.37 
 
 
182 aa  256  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  41.14 
 
 
182 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  37.3 
 
 
182 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.69 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  33.54 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  32.3 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  36.84 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  32.08 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  34.25 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.2 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  36.84 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  31.52 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.28 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.28 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  29.73 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  28.67 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  28.67 
 
 
167 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  29.03 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  38.52 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  38.52 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  38.52 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  38.52 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  38.52 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  38.52 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  27.89 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  29.94 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  27.89 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  30.49 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  30.97 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  30.49 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  30.3 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  30.3 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  30.3 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  30.49 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  34.81 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  31.17 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  30.49 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  26.98 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  27.01 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  28.22 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  32.7 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  32.7 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  30.27 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  29.57 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  29.76 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  30.95 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  29.03 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.5 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  28.82 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  30.36 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
339 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  32.52 
 
 
178 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  30.72 
 
 
182 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  24.52 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  28.75 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  28.75 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  28.75 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  31.93 
 
 
325 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  32.57 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  33.33 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  28.22 
 
 
329 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  28.22 
 
 
329 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  28.22 
 
 
329 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  31.25 
 
 
344 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  28.93 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  33.94 
 
 
228 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  30.54 
 
 
320 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  28.93 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  24.12 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  27.39 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  34.55 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.43 
 
 
333 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  31.01 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  27.33 
 
 
310 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  27.33 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>