69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2359 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  100 
 
 
177 aa  342  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  97.18 
 
 
177 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  89.27 
 
 
177 aa  290  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  78.53 
 
 
177 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  66.85 
 
 
178 aa  214  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  35.8 
 
 
181 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  40.96 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  32.6 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  32.6 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  33.68 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.54 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  35.14 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  34.59 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  34.59 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  41.35 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  31.95 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  31.18 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  31.9 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  42.86 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  42.86 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  30.46 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  32.94 
 
 
167 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  35.67 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  28.65 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  29.63 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  28.57 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  27.95 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  27.33 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  30.68 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.59 
 
 
167 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  32.05 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  31.18 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  27.17 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.58 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.95 
 
 
163 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.95 
 
 
163 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  31.64 
 
 
344 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30.95 
 
 
339 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  29.71 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.59 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  29.81 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  38.37 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  28.41 
 
 
181 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  28.8 
 
 
228 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  27.65 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  28.41 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  28.41 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  28.41 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.39 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  31.25 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  28.07 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  28.07 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  28.07 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  34.09 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.27 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.09 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  30.91 
 
 
171 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.88 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  32.09 
 
 
175 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  26.23 
 
 
321 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>