66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1799 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  345  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  82.49 
 
 
177 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  80.79 
 
 
177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  78.53 
 
 
177 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  67.42 
 
 
178 aa  218  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  36.57 
 
 
181 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  37.43 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  37.78 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  37.78 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  37.78 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  37.78 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  37.78 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  43.18 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  37.78 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  44.7 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  44.7 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  44.7 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  44.7 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  44.7 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  44.7 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  31.58 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  39.52 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  36.97 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  38.46 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  33.7 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  35.19 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  31.71 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  28.31 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  32.97 
 
 
228 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  28.31 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  29.11 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  30.72 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.71 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  29.03 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  31.06 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  28.32 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  29.88 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  29.88 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  27.33 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.26 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  27.88 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  29.29 
 
 
185 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  29.29 
 
 
194 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  28 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  30.68 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  27.93 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  28.31 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  30.86 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  30.86 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  27.93 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  27.93 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  27.93 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  26.99 
 
 
178 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  29.32 
 
 
344 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  28.75 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.1 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  36.11 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  26.38 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  27.01 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  30.46 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  27.59 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  27.59 
 
 
234 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  27.13 
 
 
321 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>