93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1665 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  99.46 
 
 
185 aa  358  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  51.66 
 
 
184 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  35.71 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  35.58 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  37.13 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  36.2 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  35.26 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  32.72 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  32.1 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  31.54 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.68 
 
 
344 aa  64.7  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  31.48 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  31.21 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  30.67 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  30.67 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  32.89 
 
 
320 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  32.69 
 
 
325 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  33.33 
 
 
372 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
176 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  30.64 
 
 
177 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  36.72 
 
 
122 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  32.14 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  33.11 
 
 
336 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  33.11 
 
 
345 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  33.11 
 
 
336 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  33.11 
 
 
336 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  33.11 
 
 
329 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  33.11 
 
 
336 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  34.44 
 
 
318 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  36.36 
 
 
167 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  36.44 
 
 
154 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  36.44 
 
 
154 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  32.85 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
339 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  32.14 
 
 
331 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  28.67 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  26.75 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  33.58 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  27.17 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  32.14 
 
 
331 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  28.67 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  30.83 
 
 
323 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  30.19 
 
 
333 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  30.38 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  27.72 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  27.27 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  28.66 
 
 
156 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  30.63 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  29.03 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.97 
 
 
323 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  27.18 
 
 
163 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  30.97 
 
 
323 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  29.03 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  29.28 
 
 
228 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  30.97 
 
 
323 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  26.63 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  26.63 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  26.63 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  26.77 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  31.65 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  26.77 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  26.77 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  26.63 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  26.63 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  26.77 
 
 
313 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  26.77 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  26.77 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  26.77 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  26.63 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  29.13 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  30.84 
 
 
324 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  30.39 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  26.95 
 
 
360 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  27.36 
 
 
321 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  27.81 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  31.06 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  28.35 
 
 
323 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  31.78 
 
 
165 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  30.47 
 
 
181 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  28.79 
 
 
177 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  27.62 
 
 
321 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  26.67 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  29.29 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  30.53 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  30.53 
 
 
172 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  30.53 
 
 
164 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  30.53 
 
 
164 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  30.53 
 
 
172 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  30.53 
 
 
164 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  27.95 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>