80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5297 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  360  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  98.9 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  39.23 
 
 
179 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  39.87 
 
 
182 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  39.86 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  39.13 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  36.11 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  36.11 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  34.93 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  35.45 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  32.92 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  31.41 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  32.3 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  37.12 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  35.61 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  37.12 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  35.61 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  35.61 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  35.61 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  35.61 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  37.12 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.67 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  35.61 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  35.61 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  33.9 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  31.06 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  34.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  34.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  32.03 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  32.04 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  32.03 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  31.33 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  28.9 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  29.65 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  26.55 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  29.79 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  31.82 
 
 
178 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  30.26 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  29.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  29.44 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  25.79 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  30.19 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  25.79 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  29.61 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  30.41 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  29.27 
 
 
234 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  29.27 
 
 
234 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  29.27 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  34.64 
 
 
205 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  30.95 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  29.03 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  30.36 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  33.74 
 
 
165 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  31.85 
 
 
190 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.92 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  28.31 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  34.16 
 
 
156 aa  51.2  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  28.67 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  28.67 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  29.78 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  28.42 
 
 
181 aa  48.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  33.33 
 
 
344 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  32.82 
 
 
339 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.5 
 
 
320 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.28 
 
 
323 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  26.15 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2060  hypothetical protein  29.21 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  29.55 
 
 
160 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  29.91 
 
 
323 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
324 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>