36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2363 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  100 
 
 		 323 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  98.45 
 
 		 323 aa  634    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  92.57 
 
 		 323 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  73.68 
 
 		 323 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  66.34 
 
 		 323 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  46.62 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  46.95 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  46.5 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  46.62 
 
 		 313 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  46.62 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  46.62 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  46.62 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  46.62 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  42.55 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  37.54 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  42.51 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  36.18 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  36.05 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  34.29 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  30.91 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  30.55 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  30.61 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  30.61 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  32.74 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  26.09 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.62 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  27.75 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  27.52 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  27.52 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  31.75 
 
 		 179 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  27.78 
 
 		 165 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.67 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.97 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  30.97 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  26.17 
 
 		 163 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  24.25 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>