110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0306 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  100 
 
 
181 aa  362  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  38.1 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  37.06 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  37.04 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  37.18 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34.86 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  30.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  31.58 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  34.35 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  38.62 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  36.88 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  38.03 
 
 
154 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  38.03 
 
 
154 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  29.32 
 
 
160 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  37.6 
 
 
122 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  36.11 
 
 
331 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  36.11 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  30.95 
 
 
124 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  36.81 
 
 
333 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  30.87 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  31.62 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  32.5 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  34.46 
 
 
313 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  34.46 
 
 
321 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  34.46 
 
 
321 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  34.46 
 
 
321 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  34.46 
 
 
321 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  34.46 
 
 
321 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  32.9 
 
 
165 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  34.46 
 
 
321 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  36.3 
 
 
315 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.92 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  34.52 
 
 
315 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  35.34 
 
 
164 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  42.05 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  42.05 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  35.34 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  31.91 
 
 
318 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 
329 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 
329 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 
329 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  30.95 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  33.96 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  33.76 
 
 
344 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  33.96 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  33.96 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  34.62 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  38.41 
 
 
336 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  38.41 
 
 
336 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  38.41 
 
 
345 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  31.29 
 
 
321 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  27.39 
 
 
177 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  33.11 
 
 
321 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  37.68 
 
 
336 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  37.68 
 
 
336 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  37.68 
 
 
336 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  26.75 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  37.68 
 
 
329 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  32.3 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  35.14 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  35.46 
 
 
372 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  31.67 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  28.32 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  28.3 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  30.39 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  28.42 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  38.16 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  29.44 
 
 
173 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  29.33 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  28.42 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  29.59 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  33.66 
 
 
167 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  27.87 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  33.66 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  29.7 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  30.19 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  30.19 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  30.19 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  30.19 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  30.08 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  30.19 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  30.19 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  30 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  32.3 
 
 
320 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  29.93 
 
 
324 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  31.71 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.68 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  27.13 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  30.23 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  38.16 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  25.93 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  32.71 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  38.89 
 
 
339 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  29.85 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  29.85 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  29.85 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  29.85 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  29.85 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>