104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03044 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  100 
 
 
325 aa  624  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  42.01 
 
 
333 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  40.37 
 
 
320 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  42.14 
 
 
331 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  42.54 
 
 
318 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  42.14 
 
 
331 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  42.31 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  41.75 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  41.75 
 
 
336 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  41.75 
 
 
329 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  41.75 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  41.75 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  41.75 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.94 
 
 
372 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.63 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  33.74 
 
 
339 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  44.29 
 
 
173 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  45.8 
 
 
174 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  47.1 
 
 
165 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  30.72 
 
 
342 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  44.12 
 
 
185 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  44.12 
 
 
172 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  44.12 
 
 
164 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  44.12 
 
 
164 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  44.12 
 
 
172 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  44.12 
 
 
164 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  42.96 
 
 
165 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  38.03 
 
 
178 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  38.03 
 
 
178 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  44.64 
 
 
167 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  40.79 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  49.6 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  49.6 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  38.73 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  40.79 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  40.79 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  39.71 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  39.71 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  41.42 
 
 
172 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  33.57 
 
 
163 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  40 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  34.19 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  34.86 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  33.12 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  41.12 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  30.88 
 
 
175 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  33.76 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  39.23 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  36.8 
 
 
160 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  28.32 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  33.75 
 
 
156 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  33.12 
 
 
177 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.19 
 
 
179 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  36.36 
 
 
184 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  34.25 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  32.69 
 
 
194 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  32.69 
 
 
185 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  33.94 
 
 
169 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  37.24 
 
 
175 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  28.01 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  33.97 
 
 
156 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  36 
 
 
160 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  27.57 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  28.39 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  27.97 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  28.43 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  27.97 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  40.2 
 
 
170 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  27.71 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  30.94 
 
 
153 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  28.14 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  26.05 
 
 
321 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  29.2 
 
 
153 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  35.44 
 
 
228 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  33.82 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  33.6 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  32.8 
 
 
124 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  34.67 
 
 
167 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  34 
 
 
167 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  34.38 
 
 
180 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  34.67 
 
 
167 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  27.11 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  31.76 
 
 
168 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  25.96 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  27.64 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
182 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  35.46 
 
 
165 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  30.91 
 
 
172 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  27.38 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.26 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  33.09 
 
 
164 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  28.18 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  33.09 
 
 
164 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  29.61 
 
 
178 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  30.82 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  30.2 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>