40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2673 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  99.09 
 
 
329 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
329 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  99.09 
 
 
329 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  46.98 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  41.47 
 
 
315 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  41.47 
 
 
315 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  35.91 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  34.13 
 
 
337 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  35.97 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  35.97 
 
 
321 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  35.57 
 
 
313 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  35.57 
 
 
321 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  35.57 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  35.57 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  35.57 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  35.57 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  33.84 
 
 
323 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  35.16 
 
 
323 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  33.09 
 
 
323 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.91 
 
 
323 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  30.91 
 
 
323 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  34.56 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  35.04 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  30.56 
 
 
321 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  27.87 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  30.17 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  30.17 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.9 
 
 
156 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  33.11 
 
 
181 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  29.7 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  27.59 
 
 
163 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  29.7 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  29.7 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  29.7 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  29.7 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  29.7 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  28.22 
 
 
182 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  29.21 
 
 
336 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  30.34 
 
 
168 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  26.64 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>