52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001219 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  100 
 
 
323 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  44.21 
 
 
323 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  42.38 
 
 
323 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  46.25 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  42.86 
 
 
323 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  43.53 
 
 
323 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  43 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  43 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  42.66 
 
 
313 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  42.66 
 
 
321 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  42.66 
 
 
321 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  42.66 
 
 
321 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  42.66 
 
 
321 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  39.32 
 
 
321 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  40.46 
 
 
321 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  36.75 
 
 
315 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  36.14 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  38.13 
 
 
310 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  43.59 
 
 
324 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  33.94 
 
 
329 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  33.94 
 
 
329 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  33.84 
 
 
329 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  31.45 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  33.78 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  31.94 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  35.88 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  26.5 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  26.81 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  27.31 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  29.79 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  28.37 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  28.37 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  28.37 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  28.37 
 
 
336 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  28.37 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  28.37 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  28.37 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.45 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  30.83 
 
 
185 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.83 
 
 
194 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  27.14 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  24.68 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  29.91 
 
 
179 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  31.01 
 
 
154 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  31.01 
 
 
154 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  30.32 
 
 
342 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.25 
 
 
163 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  27.46 
 
 
173 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  38.46 
 
 
167 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  28.85 
 
 
165 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>