49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1963 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  92.57 
 
 		 323 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  92.57 
 
 		 323 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  75.23 
 
 		 323 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  69.64 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  46.73 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  42.99 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  46.73 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  47.06 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  46.73 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  46.73 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  46.73 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  46.73 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  46.73 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  38.39 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  42.03 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  35.62 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  35.49 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  34.15 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  31.64 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  33.93 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  33.09 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  32.73 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  32.73 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.71 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  27.11 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.13 
 
 		 179 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.45 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  26.85 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  29.17 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.47 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  26.85 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.47 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  34.44 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.97 
 
 		 194 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  30.97 
 
 		 185 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  35.16 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  31 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  25.37 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  26.83 
 
 		 167 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  31.18 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  23.51 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>