60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1638 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  99.69 
 
 
321 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  100 
 
 
321 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  99.38 
 
 
321 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  99.69 
 
 
321 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  99.69 
 
 
321 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  99.69 
 
 
321 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  99.36 
 
 
313 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  93.15 
 
 
321 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  47.06 
 
 
323 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  48.18 
 
 
323 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  47.87 
 
 
323 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  48.04 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  46.95 
 
 
323 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  43 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  36.58 
 
 
315 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  39.6 
 
 
324 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  36.15 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  35.1 
 
 
310 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  37.5 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  35.06 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  34.84 
 
 
329 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  34.49 
 
 
329 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  34.49 
 
 
329 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  35.29 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  28.43 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  26.8 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  26.32 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  34.46 
 
 
181 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  27.34 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  27.34 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  27.34 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  27.34 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  27.34 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  27.34 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  27.34 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  34.09 
 
 
153 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  28.17 
 
 
163 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  27.67 
 
 
339 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  28.06 
 
 
331 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  32.87 
 
 
167 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  27.86 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  34.81 
 
 
165 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  28.87 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  31.94 
 
 
168 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  31.75 
 
 
167 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  32.48 
 
 
122 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  36.89 
 
 
179 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.49 
 
 
320 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  25.9 
 
 
173 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  31.08 
 
 
178 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  25.97 
 
 
184 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  29.27 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  33.01 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.69 
 
 
171 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  32.69 
 
 
177 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  33.01 
 
 
180 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  26.77 
 
 
185 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  26.77 
 
 
194 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  32.04 
 
 
178 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  29.22 
 
 
176 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>