59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5302 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  97.78 
 
 
315 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  46.45 
 
 
336 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  42.72 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  41.22 
 
 
310 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  42.14 
 
 
329 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  42.14 
 
 
329 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  41.47 
 
 
329 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  35.57 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  35.47 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  35.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  35.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  35.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  35.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  35.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  36.42 
 
 
321 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  35.84 
 
 
323 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  35.62 
 
 
323 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  32.9 
 
 
321 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  35.93 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  35.59 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  38.2 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  37.62 
 
 
324 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  34.88 
 
 
323 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  34.04 
 
 
165 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  27.71 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  35.86 
 
 
165 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  42.62 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  29.73 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  35.25 
 
 
167 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  33.1 
 
 
168 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  34.52 
 
 
181 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  39.67 
 
 
171 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  34.75 
 
 
173 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  39.67 
 
 
177 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.67 
 
 
156 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  34.75 
 
 
164 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  34.75 
 
 
164 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  34.75 
 
 
164 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  34.75 
 
 
172 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  34.75 
 
 
172 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  27.53 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  34.75 
 
 
185 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.19 
 
 
184 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.19 
 
 
184 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  30.06 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  32.41 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  34.29 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.05 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  35.46 
 
 
165 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  31.76 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  34.11 
 
 
175 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.35 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  33.96 
 
 
178 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  29.7 
 
 
178 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  35.94 
 
 
167 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  28.68 
 
 
153 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
174 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  26.35 
 
 
167 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>