33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2820 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  100 
 
 		 336 aa  677    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  76.26 
 
 		 337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  46.45 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  45.48 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  36.53 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  36.53 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  35.91 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  35.79 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  37.77 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  36.48 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  36.48 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  36.48 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  36.48 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  36.48 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  36.48 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  36.48 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  34.15 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  27.16 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  31.69 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  32.86 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  32.64 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  30.4 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  33.66 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  31.82 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  27.64 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.84 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  31.08 
 
 		 156 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 		 165 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  28.86 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  28.65 
 
 		 179 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  29.87 
 
 		 171 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  30.6 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>