50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3668 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  100 
 
 		 323 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  68.65 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  68.54 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  65.22 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  64.91 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  47.53 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  47.22 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  47.22 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  47.22 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  47.22 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  47.37 
 
 		 313 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  46.91 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  46.6 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  43.9 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  37.66 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  45.69 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  37.91 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  34.19 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  34.52 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  34.26 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  33.95 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  33.95 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  31.82 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  31.04 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.73 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  29.45 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  26.07 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  30.61 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  30.92 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  28.95 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  28.81 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  31.72 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  29.49 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  35.87 
 
 		 153 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  24.9 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  30.41 
 
 		 173 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  25.82 
 
 		 178 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.64 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  29.93 
 
 		 184 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  29.93 
 
 		 184 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  37.21 
 
 		 154 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  37.21 
 
 		 154 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>