101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03041 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  100 
 
 		 173 aa  338  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  65.44 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  65.44 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  65.44 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  65.44 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  65.44 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  65.44 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  58.9 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  55.75 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  62.5 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  53.89 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  52.11 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  57.45 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  51.11 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  44.29 
 
 		 325 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  53.28 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  53.28 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  42.03 
 
 		 331 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  44.76 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  41.3 
 
 		 331 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  40.28 
 
 		 339 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  38.24 
 
 		 344 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  40.97 
 
 		 320 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  37.76 
 
 		 333 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  46.32 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 345 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 336 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  37.91 
 
 		 336 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  39.71 
 
 		 336 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 336 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 336 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 329 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 372 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  36.71 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  37.78 
 
 		 318 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  39.61 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  38.76 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  36.69 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  36.69 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.94 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  34.21 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  42.03 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  33.53 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  36.62 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  29.94 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.48 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  35.82 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  35.82 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  35.71 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  32.5 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  30.66 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  32.48 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  34.62 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  30.46 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  33.81 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  27.62 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  31.1 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  30.27 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  34.75 
 
 		 315 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  34.75 
 
 		 315 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  31.25 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  26.71 
 
 		 310 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  27.17 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  30.23 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  27.17 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  33.54 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  29.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  25.9 
 
 		 321 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  25.9 
 
 		 321 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  25.9 
 
 		 321 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  25.9 
 
 		 321 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.12 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  25.9 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  25.9 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  31.68 
 
 		 325 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  25.9 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  29.56 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  30.71 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  29.53 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  30.19 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  28.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  27.46 
 
 		 323 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  31.71 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  30.46 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  27.91 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  30.86 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  27.08 
 
 		 323 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  29.69 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  24.46 
 
 		 321 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  34.62 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  28.99 
 
 		 324 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>