65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3672 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  100 
 
 		 178 aa  342  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  75.16 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  71.24 
 
 		 177 aa  220  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  67.42 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  69.28 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  36.47 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  36.07 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  35.48 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  34.83 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  34.97 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  41.01 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  38.18 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  31.52 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  42.11 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  42.11 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  42.11 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  31.82 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  32.3 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  30.98 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  32.34 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  32.93 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  32.16 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  33.33 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  29.63 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  32.18 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  30.36 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.99 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  29.03 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  31.45 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.92 
 
 		 184 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.92 
 
 		 184 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  30.16 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.07 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  38.89 
 
 		 344 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.39 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  28.31 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  27.95 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.39 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  27.95 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  28.4 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  29.31 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  29.05 
 
 		 325 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  32.08 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.91 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  27.78 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  29.29 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  29.01 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  26.32 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.14 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  31.82 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  29.14 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  29.36 
 
 		 323 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  30.13 
 
 		 336 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  30.13 
 
 		 345 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  28.03 
 
 		 323 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  37.5 
 
 		 331 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>