40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1803 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  75.23 
 
 		 323 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  73.68 
 
 		 323 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  73.68 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  69.64 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  47.71 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  48.04 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  47.71 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  47.71 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  47.71 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  47.71 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  47.71 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  47.71 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  40.85 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  36.45 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  39.66 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  36.96 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  36.86 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  36.86 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  35.84 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  35.49 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  35.49 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  32.04 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  30.42 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  25.96 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.11 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  26.9 
 
 		 163 aa  52.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  28.29 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  29.63 
 
 		 184 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  29.63 
 
 		 184 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  26.92 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  26.92 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  39.76 
 
 		 153 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  26.03 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  25.47 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  27.81 
 
 		 165 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  29.49 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  28.1 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  29.36 
 
 		 178 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>