67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1923 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  100 
 
 
168 aa  318  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  47.24 
 
 
325 aa  91.7  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  38.98 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  34.59 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  38.76 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  44.22 
 
 
342 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  40.65 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  37.67 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  37.75 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  37.75 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  39.33 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  36.51 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  40.6 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  36.99 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  34.96 
 
 
344 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  36.99 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  36.99 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  36.5 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  32.65 
 
 
310 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  39.07 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  34.9 
 
 
339 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  33.1 
 
 
315 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  33.1 
 
 
315 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  37.09 
 
 
178 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  34.29 
 
 
153 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.41 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  29.19 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  31.76 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  36.11 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  31.94 
 
 
313 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  31.94 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  31.94 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  31.94 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  28.49 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  30.86 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  28.67 
 
 
337 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  33.1 
 
 
321 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  28.93 
 
 
333 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  36.3 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  36.3 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  35.76 
 
 
178 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  30.34 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  30.34 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  30.34 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  29.63 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  30.63 
 
 
331 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  30.63 
 
 
331 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  30.71 
 
 
324 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.13 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  31.39 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  30.23 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  28.11 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  36.75 
 
 
122 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  31.01 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  31.87 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  31.01 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  31.01 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  36.22 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  36.22 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  27.27 
 
 
336 aa  40.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  29.67 
 
 
185 aa  40.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>