89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2696 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  100 
 
 
167 aa  322  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  79.64 
 
 
167 aa  208  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  42.94 
 
 
173 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  45.39 
 
 
164 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  45.39 
 
 
164 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  45.39 
 
 
164 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  45.39 
 
 
185 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  45.39 
 
 
172 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  45.39 
 
 
172 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  41.29 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  40.22 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  42.47 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  46.1 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  44.64 
 
 
325 aa  88.6  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  40.43 
 
 
331 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  51.06 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  40.43 
 
 
331 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  51.06 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  46.02 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  40.88 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  42.55 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  41.94 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  42.55 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  38.04 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  39.47 
 
 
318 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  33.73 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  40 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  40 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  42.73 
 
 
339 aa  73.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  36.17 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  36.17 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  36.17 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  35.46 
 
 
336 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  35.46 
 
 
336 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  35.46 
 
 
336 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  35.46 
 
 
329 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  34.39 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  39.33 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  34.94 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  37.41 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  35.51 
 
 
372 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  33.81 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  37.41 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.49 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  27.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  36.59 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  34.62 
 
 
320 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  35.4 
 
 
315 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  33.33 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  34.78 
 
 
315 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  31.85 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  50.72 
 
 
342 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  34.55 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  34.55 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  34.55 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  33.13 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  33.15 
 
 
228 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  31.54 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  38.04 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  35.51 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  31.37 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  44.83 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  45.98 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  32.87 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  32.87 
 
 
313 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  35.45 
 
 
182 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  32.87 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  32.87 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  32.87 
 
 
321 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  32.87 
 
 
321 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  32.87 
 
 
321 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  35.45 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  33.64 
 
 
321 aa  50.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  40 
 
 
324 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  31.25 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  35.17 
 
 
325 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  33.03 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  33.03 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  26.79 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  29.73 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  29.44 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  27.88 
 
 
174 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  29.44 
 
 
185 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  28.87 
 
 
329 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  28.87 
 
 
329 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  28.87 
 
 
329 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  24.84 
 
 
148 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>