86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0341 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  100 
 
 
122 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  41.73 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  41.73 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  39.37 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  38.89 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  38.1 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  36.07 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  41.12 
 
 
325 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  36.3 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  35.94 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  36.89 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  35.25 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  39.52 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  42.2 
 
 
331 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  34.19 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  30.71 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  36.59 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  38.21 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  41.28 
 
 
331 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  34.19 
 
 
180 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  40.21 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  39.66 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  37.6 
 
 
181 aa  60.1  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  35.61 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  36.72 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  36.72 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  39.67 
 
 
228 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  34.35 
 
 
318 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  40.19 
 
 
345 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  36.75 
 
 
333 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  34.85 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  34.86 
 
 
320 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  40.19 
 
 
336 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  40.19 
 
 
336 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  40.19 
 
 
336 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  40.19 
 
 
336 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  40.19 
 
 
329 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  40.19 
 
 
336 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.25 
 
 
372 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  37.3 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  39.23 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  36.51 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  35.4 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  35.43 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  35.43 
 
 
339 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  31.86 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  31.62 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  32.48 
 
 
313 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  31.62 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  31.62 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  32.48 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  31.62 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  31.62 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  29.41 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  31.82 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  29.41 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  29.41 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  28.46 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  35.16 
 
 
173 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  33.08 
 
 
344 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  33.85 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  33.86 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  31.62 
 
 
321 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  33.85 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  33.85 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  33.85 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  33.85 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  33.85 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  33.08 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  38.1 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  43.48 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  43.48 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  27.78 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  33.08 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  27.78 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  27.78 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  32.81 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  30.77 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  26.98 
 
 
174 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  36.75 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  33.59 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  32.26 
 
 
321 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  39.44 
 
 
342 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>