70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1920 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  100 
 
 
342 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  35.97 
 
 
344 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  30.72 
 
 
325 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  30.5 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  44.59 
 
 
168 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  42.75 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  40.15 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  41.84 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  37.41 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  37.41 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  37.41 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  37.41 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  37.41 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  37.41 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  30.59 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  28.67 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  29.53 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  29.43 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  27.99 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  36.62 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  28 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  36.69 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  38.56 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  43.41 
 
 
175 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  39.84 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  29.48 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  33.33 
 
 
156 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  39.31 
 
 
167 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  35.21 
 
 
163 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  27.38 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  27.38 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  27.38 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  27.38 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  27.38 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  27.38 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  37.66 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  30.54 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  39.01 
 
 
178 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  39.01 
 
 
178 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  37.5 
 
 
167 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  36.88 
 
 
178 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  42.19 
 
 
170 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  42.19 
 
 
170 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  33.53 
 
 
189 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  32.86 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  40.56 
 
 
165 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  31.16 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  30.32 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  31.01 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  31.01 
 
 
194 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  32.37 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  34.48 
 
 
154 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  34.48 
 
 
154 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  32 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.87 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  34.19 
 
 
122 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  30.07 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  31.54 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.3 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  32.37 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.3 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  38.13 
 
 
164 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  38.13 
 
 
164 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  32.54 
 
 
182 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  30.65 
 
 
176 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.8 
 
 
167 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.89 
 
 
163 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.89 
 
 
163 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>