86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2994 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  99.39 
 
 
185 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  99.39 
 
 
172 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  98.78 
 
 
172 aa  308  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  92.07 
 
 
172 aa  236  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  78.46 
 
 
174 aa  208  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  71.34 
 
 
165 aa  207  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  68.24 
 
 
178 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  73.94 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  69.41 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  63.98 
 
 
173 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  48.03 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  45.77 
 
 
331 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  45.77 
 
 
331 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  47.55 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  53.97 
 
 
170 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  42.96 
 
 
325 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  53.97 
 
 
170 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  37.84 
 
 
333 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  40.29 
 
 
318 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.49 
 
 
372 aa  94.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  41.01 
 
 
345 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  41.01 
 
 
336 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  41.01 
 
 
336 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  39.57 
 
 
336 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  38.57 
 
 
344 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  39.57 
 
 
336 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  45.45 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  39.57 
 
 
336 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  39.57 
 
 
329 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  38.85 
 
 
320 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  46.32 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  35.06 
 
 
339 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  39.86 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  39.86 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  40.43 
 
 
342 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  37.11 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.87 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  35.62 
 
 
171 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  35 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  35.16 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  37.93 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  35.51 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  37.18 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  36.65 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  36.65 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  36.65 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  36.43 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  36.43 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  31.43 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  36.84 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  33.99 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  35.37 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  36.84 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.56 
 
 
194 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  35.14 
 
 
315 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  35.14 
 
 
315 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  38.57 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  34.23 
 
 
325 aa  54.3  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  28.57 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  30.95 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  34.62 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
175 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  31.01 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  30.72 
 
 
228 aa  47.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  30.56 
 
 
310 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  32.41 
 
 
337 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  32.02 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  28.97 
 
 
324 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  29.25 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  32.1 
 
 
177 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  31.52 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  29.81 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  31.67 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  27.98 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  28.14 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  31.29 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  27.38 
 
 
167 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  30.28 
 
 
336 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  31.37 
 
 
323 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  23.91 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  26.14 
 
 
323 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>