66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2056 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  100 
 
 
175 aa  357  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  42.31 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  38.17 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  31.72 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  36.49 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  36.49 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  31.87 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  32.5 
 
 
333 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  35.61 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  32.14 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  35.61 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  35.71 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  32.06 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  32.87 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  32.06 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  35.16 
 
 
336 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  30.88 
 
 
325 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  35.16 
 
 
336 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  35.16 
 
 
345 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  32.82 
 
 
331 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  35.16 
 
 
336 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  35.16 
 
 
336 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  35.16 
 
 
336 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  35.16 
 
 
329 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  30.3 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  32.61 
 
 
372 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  30.71 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  33.33 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  31.3 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  28.93 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  30.08 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  31.62 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.54 
 
 
344 aa  54.7  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  28.17 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  27.06 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  25.19 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  25.19 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  25.19 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  27.06 
 
 
167 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  32.09 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  27.27 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  26.47 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  26.92 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  26.45 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  26.36 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  25.6 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.63 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  30.63 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  30.08 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  30.3 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  23.88 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  23.7 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.1 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  26.15 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  25.19 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  25.93 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  26.15 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  25.19 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  32.65 
 
 
339 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  26.39 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  25.68 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  25.32 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  31.52 
 
 
170 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  31.52 
 
 
170 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>