71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3673 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  100 
 
 		 177 aa  357  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  47.47 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  45.57 
 
 		 178 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  45.16 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  45.16 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  39.46 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  40 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  37.43 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  37.65 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  34.57 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  34.22 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  34.22 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  34.22 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  34.57 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  33.16 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  36.98 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  36.55 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  34.48 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  34.48 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  32.96 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  30.2 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  35.61 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  31.11 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  33.33 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  31.18 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  33.12 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  29.89 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  29.65 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  29.65 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  28.49 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  29.61 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  27.93 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  34.81 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  31.21 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  30.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  31.68 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  29.94 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  25.16 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  27.72 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  28.22 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  30.56 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.09 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  27.71 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.41 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  32.03 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  28.91 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  32.03 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  26.8 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  26.8 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  29.21 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  31.58 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  28.12 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  27.74 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  27.59 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  27.81 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  25.68 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>