49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0344 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  38.82 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  35.91 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  32.56 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  33.52 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  32.21 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  33.76 
 
 
333 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  33.11 
 
 
331 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  30.95 
 
 
331 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  31.76 
 
 
325 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  31.54 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  40 
 
 
165 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  35.25 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  35.25 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  35.25 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  35.25 
 
 
172 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  35.25 
 
 
172 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  35.25 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  32.14 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  29.37 
 
 
175 aa  50.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  35.16 
 
 
122 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.65 
 
 
320 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  31.87 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  34.59 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  34.19 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  34 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  35.17 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  28.9 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  34.51 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  32.58 
 
 
336 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.64 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  32.05 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  33.56 
 
 
329 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  33.11 
 
 
345 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  33.11 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  33.56 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  33.56 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  33.56 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  36.11 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  31.52 
 
 
372 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  33.03 
 
 
178 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  27.75 
 
 
177 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.13 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  27.93 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  30.93 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  30.93 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>