131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  357  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  97.22 
 
 
182 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  55.92 
 
 
178 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  52.3 
 
 
178 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  40.76 
 
 
184 aa  120  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  34.43 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  35.2 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  37.91 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  38.51 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.7 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  37.84 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  38.26 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  33.52 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  35.84 
 
 
333 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.58 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  41.51 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  33.15 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  40.57 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  34.4 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  34.4 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  34.4 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  35.71 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  33.12 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  33.12 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  33.12 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  34.19 
 
 
122 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  28.42 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  32.88 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  31.82 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  36 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  32.08 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  32.48 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  32.67 
 
 
372 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  32.45 
 
 
336 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  27.04 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  32.45 
 
 
336 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  32.45 
 
 
336 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  32.45 
 
 
336 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  32.45 
 
 
345 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  32.45 
 
 
336 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  32.45 
 
 
329 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  30.26 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  30 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  33.88 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  33.88 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  31.11 
 
 
318 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  33.59 
 
 
344 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  32.8 
 
 
325 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  37.9 
 
 
320 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  33.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  33.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  33.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  33.86 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  33.07 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  33.86 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  33.86 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  31.02 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  32.43 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  27.33 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  29.38 
 
 
175 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  35.45 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  29.87 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  29.87 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  34.65 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  30.05 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  30.63 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  34.34 
 
 
339 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  26.45 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  28.3 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  29.95 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  32.41 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  31.11 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  31.11 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  29.22 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  34.23 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  34.65 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  27.56 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  32.03 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  28.14 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  35.45 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  28.92 
 
 
186 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  30.94 
 
 
124 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  29.59 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  32.17 
 
 
173 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  37.23 
 
 
156 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  28.92 
 
 
186 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  28.92 
 
 
186 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  28.92 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  28.92 
 
 
186 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  28.92 
 
 
186 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  30.63 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  30 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  29.79 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  33.01 
 
 
313 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  33.01 
 
 
321 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  33.01 
 
 
321 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  33.01 
 
 
321 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>