59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1958 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  95.51 
 
 		 178 aa  324  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  94.94 
 
 		 178 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  87.08 
 
 		 178 aa  297  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  45.57 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  34.3 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  34.3 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  34.3 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  34.3 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  35.58 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  32.12 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  34.38 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  31.75 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  33.59 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  33.59 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  33.59 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  33.11 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  28.75 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  29.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.95 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  31.28 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  29.57 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  29.57 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  27.33 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  27.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  29.63 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  31.25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  29.22 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  27.89 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  29.22 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  25.27 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  30.32 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  32.32 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  26.38 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  30.71 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.28 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  31.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  31.3 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  31.3 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  26.2 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  26.9 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  27.66 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  25.66 
 
 		 181 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  28 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  27.81 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>