61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2358 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  100 
 
 
178 aa  353  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  99.44 
 
 
178 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  94.94 
 
 
178 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  84.27 
 
 
178 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  45.16 
 
 
177 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  35.47 
 
 
167 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  35.47 
 
 
167 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  35.47 
 
 
167 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  35.47 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  36.2 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  36.2 
 
 
234 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  36.2 
 
 
234 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  33.13 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  33.94 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  31.74 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  34.92 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  34.92 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  34.92 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  34.92 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  34.92 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  34.92 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  34.13 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  31.75 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  29.81 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  32.88 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30.95 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  28.57 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  35.66 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.67 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  29.57 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  29.57 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  27.33 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  29.05 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  31.61 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  29.87 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  28.4 
 
 
177 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  25.82 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  31.21 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  27.37 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  27.37 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  28.75 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.84 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.84 
 
 
163 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  30.71 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.68 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  27.37 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.99 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  28.3 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  30.14 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  27.17 
 
 
169 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.01 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  29.2 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  29.2 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>