80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  98.9 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  38.55 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  39.87 
 
 
182 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  39.86 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  39.13 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  36.81 
 
 
167 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  36.81 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  35.62 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  35.45 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  32.92 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  32.05 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  32.3 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  36.36 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  37.88 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  37.88 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  37.88 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  36.36 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  36.36 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  28.67 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  33.9 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  31.06 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  32.6 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  32 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  32.03 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  32.03 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  34.44 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  34.44 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  28.9 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  26.55 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  29.65 
 
 
177 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  31.52 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  30.92 
 
 
167 aa  61.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  28.89 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  30.22 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  30.19 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  29.44 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  25.79 
 
 
197 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  25.79 
 
 
197 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  27.81 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  35.2 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  30.41 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  29.27 
 
 
234 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  30.95 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  29.27 
 
 
234 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  29.27 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  29.03 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  30.36 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  34.36 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  28.31 
 
 
177 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  31.85 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  34.16 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  30.92 
 
 
178 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  28.67 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  28.67 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  30 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  34.13 
 
 
344 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  29.59 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  32.82 
 
 
339 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2060  hypothetical protein  29.78 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.5 
 
 
320 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.28 
 
 
323 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  26.15 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  29.55 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  29.91 
 
 
323 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
324 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>