74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1270 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  100 
 
 
174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  78.18 
 
 
165 aa  233  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  71.84 
 
 
178 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  77.33 
 
 
178 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  71.84 
 
 
178 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  77.21 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  77.21 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  77.21 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  77.21 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  77.21 
 
 
172 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  77.21 
 
 
172 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  55.75 
 
 
173 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  77.21 
 
 
172 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  47.92 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  45.45 
 
 
325 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  45.71 
 
 
331 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  45.71 
 
 
331 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  56.45 
 
 
170 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  56.45 
 
 
170 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  47.3 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  44.06 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  40 
 
 
333 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  41.73 
 
 
318 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  43.54 
 
 
320 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  38.89 
 
 
339 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  46.32 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  35.66 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  38.85 
 
 
345 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  38.85 
 
 
336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  38.13 
 
 
372 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  38.85 
 
 
336 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  38.85 
 
 
336 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  38.85 
 
 
336 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  38.85 
 
 
336 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  38.85 
 
 
329 aa  84.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  40.4 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  36.61 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  35.46 
 
 
344 aa  82  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  40.56 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  40.56 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  39.6 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  37.5 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  35.43 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  38.1 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  35.43 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  35.43 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  29.83 
 
 
172 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  37.3 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  35.85 
 
 
325 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  33.91 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  34.5 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  34.5 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  33.07 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  32.06 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  33.07 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  36.55 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  32.5 
 
 
310 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  35.77 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  35.04 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  30.32 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  27.93 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  30.2 
 
 
336 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  31.43 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  39.53 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  23.7 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  32.71 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  26.04 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  34.83 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  28.87 
 
 
323 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  27.37 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  32.81 
 
 
122 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  27.7 
 
 
323 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>