36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1829 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  100 
 
 
172 aa  343  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  38.98 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  34.97 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  36.99 
 
 
325 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  30.46 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  36.36 
 
 
342 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  34.51 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  28.93 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  26.85 
 
 
165 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  27.15 
 
 
344 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  29.66 
 
 
339 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  30.16 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  29.81 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.83 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  30.91 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  31.25 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  28.57 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  28.57 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  28.57 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  29.17 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  24.38 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  25.98 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  35.14 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  35.14 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  26.67 
 
 
331 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  27.74 
 
 
331 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  26.58 
 
 
337 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  26.71 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  27.85 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  27.85 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  24.31 
 
 
318 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  25.47 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  26.54 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>