73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1959 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  344  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  92.09 
 
 		 177 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  89.27 
 
 		 177 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  82.49 
 
 		 177 aa  279  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  71.91 
 
 		 178 aa  231  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  36.46 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  34.74 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.18 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  41.67 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  38.92 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  37.79 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  37.79 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  32.53 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  32.53 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  37.18 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  40.91 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  40.91 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  40.91 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  40.91 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  40.91 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  40.91 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  30.54 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  30.99 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  33.94 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  30.95 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  32.16 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30.59 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  28.32 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  31.89 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  30.59 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  29.63 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  30.16 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  33.33 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  30 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  31.49 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  28.4 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  31.25 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  28.89 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  27.78 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  31.82 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  31.82 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  28.89 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  35.05 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  35.05 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  29.03 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  27.06 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  29.34 
 
 		 339 aa  47.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.26 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.59 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  34.59 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  27.27 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  32.94 
 
 		 344 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  26.37 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  27.5 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  31.82 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  30.72 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  27.45 
 
 		 182 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  30.72 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  30.72 
 
 		 164 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  34.62 
 
 		 331 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  30.72 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  30.72 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  30.52 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>