19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2060 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  278  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2059  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  34.5 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  30.34 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  30.34 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  26.44 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  31.61 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  27.65 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  29.05 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  29.05 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  25.56 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  31.46 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  27.88 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34.75 
 
 		 325 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  26.92 
 
 		 323 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  27.88 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  27.88 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  26.79 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>