More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1825 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1103  ABC transporter, permease protein  57.92 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.94 
 
 		 583 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0820586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1098  ABC transporter, permease protein  57.92 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.99 
 
 		 582 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5551  ABC transporter, permease protein  67.47 
 
 		 584 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.88 
 
 		 583 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0754  ABC transporter, permease protein  57.92 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3027  ABC transporter, permease protein  57.92 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5091  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.18 
 
 		 584 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1825  putative nitrate transport system permease protein  100 
 
 		 584 aa  1148    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.54 
 
 		 584 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.242403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1256  ABC transporter, permease protein  57.92 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.76 
 
 		 578 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5725  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  57.31 
 
 		 585 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0971  ABC anion transporter, fused inner membrane subunits  58.94 
 
 		 583 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 		 585 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.97 
 
 		 584 aa  1137    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.82 
 
 		 584 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.856816  hitchhiker  0.00000224525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.61 
 
 		 584 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183914 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1570  ABC transporter, permease protein  57.92 
 
 		 585 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0850001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0896  ABC transporter, permease protein  57.75 
 
 		 585 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7462  ABC transporter permease  65.5 
 
 		 585 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3383  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.58 
 
 		 583 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0997  ABC transporter, permease protein  57.75 
 
 		 585 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 		 584 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775381  normal  0.572944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 		 585 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 		 584 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.77824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.8 
 
 		 582 aa  685    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371036  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.9 
 
 		 602 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1455  ABC transporter permease  60.84 
 
 		 585 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 		 585 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.86 
 
 		 584 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 		 585 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  0.0182448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 		 585 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0891298  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 		 584 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7488  ABC transporter permease  61.55 
 
 		 577 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5498  ABC-type anion transport system, duplicated permease component  59.46 
 
 		 556 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.55 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.3 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.3 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0622  ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 		 577 aa  595  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.974314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0759  ABC transporter, permease protein  60.3 
 
 		 577 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.72 
 
 		 579 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.69 
 
 		 600 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.904436  normal  0.911733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0770  ABC transporter, permease protein  60.11 
 
 		 577 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0935  putative transmembrane transporter  60.11 
 
 		 576 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.82 
 
 		 577 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 		 578 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.03 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2950  ABC transporter, permease protein  56.72 
 
 		 538 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0135  hypothetical protein  49.91 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0120  hypothetical protein  49.91 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.53 
 
 		 577 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3030  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.81 
 
 		 584 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.374129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1967  ABC transporter, permease protein  50.89 
 
 		 581 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 		 581 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.583197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3371  putative transmembrane ABC transporter protein  52.2 
 
 		 586 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0234  ABC transporter permease protein  50.53 
 
 		 581 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.198469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.46 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 		 575 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 		 572 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.270543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 		 588 aa  442  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0346  ABC transporter, permease protein  43.55 
 
 		 582 aa  429  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 574 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 		 581 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.477962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 		 578 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.035099  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 		 570 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 		 583 aa  352  7e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807719  hitchhiker  0.00198291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 		 576 aa  350  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0405  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.63 
 
 		 573 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00121566  decreased coverage  0.00950402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 		 671 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3497  hypothetical protein  53.11 
 
 		 671 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 		 670 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.98 
 
 		 671 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3819  ABC transporter, inner membrane subunit  49.59 
 
 		 579 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 		 497 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.105704 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.33 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.87 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.58 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.856839  hitchhiker  0.00160873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 		 458 aa  103  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.37 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.37 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  28.27 
 
 		 279 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.75 
 
 		 279 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  26.84 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.73 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  29.1 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  27.09 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.93 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.79 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 315 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>