More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3315 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
315 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  67.75 
 
 
349 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.22 
 
 
323 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  65.81 
 
 
321 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  65.81 
 
 
321 aa  427  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.13 
 
 
329 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.87 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.85 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.21 
 
 
332 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.82 
 
 
362 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  61.17 
 
 
337 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  57.86 
 
 
360 aa  346  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.19 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1968  nitrate ABC transporter, permease component  48.67 
 
 
377 aa  249  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
286 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  35.58 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.33 
 
 
279 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  36.46 
 
 
287 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
280 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.02 
 
 
295 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.49 
 
 
281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
279 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.59 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  35.32 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.59 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  38.16 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.02 
 
 
331 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  39.09 
 
 
288 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  33.98 
 
 
272 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 
256 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  33.11 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 
279 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  33.9 
 
 
287 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.02 
 
 
279 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 
280 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 
280 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
293 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  33.79 
 
 
278 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.92 
 
 
282 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
279 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  32.88 
 
 
299 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 
279 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.11 
 
 
283 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.61 
 
 
315 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  33.66 
 
 
312 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  31.49 
 
 
273 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 
280 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.73 
 
 
279 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  34.25 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  31.03 
 
 
279 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  35.54 
 
 
295 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
277 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
277 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
313 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 
310 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
313 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.19 
 
 
280 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  31.29 
 
 
303 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  31.92 
 
 
300 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
280 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
298 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  40.39 
 
 
279 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
280 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.93 
 
 
311 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  32.82 
 
 
314 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  35.74 
 
 
263 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  40.83 
 
 
328 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
304 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
304 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 
304 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  38.14 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
313 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  33.33 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.87 
 
 
286 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.17 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  29.46 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  31.94 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
251 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
251 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
280 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>