More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4495 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  99.3 
 
 		 285 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  94.06 
 
 		 286 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  81.6 
 
 		 288 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  72.56 
 
 		 304 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  72.5 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.16 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.25 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  65.97 
 
 		 297 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  72.54 
 
 		 297 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  72.15 
 
 		 297 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  58.76 
 
 		 280 aa  332  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  59.93 
 
 		 280 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  57.85 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  57.85 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  53.53 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  62.3 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.71 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.36 
 
 		 280 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.64 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.64 
 
 		 280 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  52.99 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  49.8 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  54 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.03 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 		 309 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.68 
 
 		 280 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.68 
 
 		 280 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  45.53 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.97 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  42.54 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  44.74 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  46.5 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.91 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.53 
 
 		 313 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.53 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  44.44 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.29 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  46.61 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.18 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  43.03 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.29 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.18 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.74 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.21 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.88 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.4 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  44.05 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  43.4 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  44.12 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.43 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  41.04 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.29 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  43.97 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  44.05 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  42.29 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.1 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  38.89 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.67 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.04 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  41.03 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  33.45 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  34.98 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  38.24 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.67 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.56 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.73 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.2 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  37.24 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  37.06 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 		 252 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.9 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>