More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3486 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  73.88 
 
 
287 aa  431  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  75.25 
 
 
288 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  72.04 
 
 
272 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  71.57 
 
 
295 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  70 
 
 
279 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  69.97 
 
 
279 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  69.31 
 
 
279 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  68.51 
 
 
279 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2404  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  68.62 
 
 
279 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.59 
 
 
279 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  70.24 
 
 
279 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0996  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  67.92 
 
 
286 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  67.59 
 
 
280 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4817  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  71.53 
 
 
279 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775678  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0963  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  64.48 
 
 
281 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.563275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  61.46 
 
 
279 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.34 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.21 
 
 
313 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.21 
 
 
313 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  51.79 
 
 
305 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  53.39 
 
 
279 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2106  nitrate transport permease  55.79 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.727969  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.57 
 
 
331 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.62 
 
 
315 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.94 
 
 
280 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.94 
 
 
280 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  52.49 
 
 
283 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.91 
 
 
293 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.34 
 
 
310 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.44 
 
 
328 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  52.8 
 
 
282 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.67 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  51.67 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  48.87 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  47.98 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  48.87 
 
 
287 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2376  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.67 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  41.67 
 
 
297 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  49.09 
 
 
283 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  46.15 
 
 
328 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  50.73 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  53.06 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  51.71 
 
 
303 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0055  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47 
 
 
256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  46.19 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.73 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  46.75 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
285 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  43.42 
 
 
312 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  48.67 
 
 
304 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  47.79 
 
 
309 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  41.29 
 
 
285 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3744  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.17 
 
 
288 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.441454  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  45.7 
 
 
311 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
304 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
277 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
277 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50.51 
 
 
304 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 
280 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  44.84 
 
 
297 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2503  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 
298 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2908  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
298 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  43.42 
 
 
297 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4541  nitrate transport permease  49.3 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1759  nitrate transport permease  46.43 
 
 
299 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  42.17 
 
 
279 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  40.36 
 
 
273 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  41.38 
 
 
279 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  41.82 
 
 
279 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  42.54 
 
 
278 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
280 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
323 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
329 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  34.74 
 
 
321 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2265  2-isopropylmalate synthase  40.78 
 
 
337 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20736  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  34.74 
 
 
321 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3315  putative nitrate ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1664  putative ABC transporter permease protein  35.08 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453487  normal  0.0661868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
330 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
320 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
362 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
356 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454985  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
252 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.8 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1968  nitrate ABC transporter, permease component  31.05 
 
 
377 aa  142  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
319 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.69 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  38.33 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
314 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.36 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  40.34 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>